Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND1Q9NSA2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCND1Q9NSA2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms