Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMCO4Q9NRQ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMCO4Q9NRQ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms