Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPHNQ9NQX3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPHNQ9NQX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPHNQ9NQX3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms