Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC31BQ9NQW1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31BQ9NQW1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC31BQ9NQW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC31BQ9NQW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms