Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRPL40Q9NQ50 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms