Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP13A2Q9NQ11 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A2Q9NQ11 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A2Q9NQ11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms