Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD93Q9NPY3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD93Q9NPY3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD93Q9NPY3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms