Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDH12Q9NPG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH12Q9NPG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH12Q9NPG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms