Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC4Q9NPD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC4Q9NPD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC4Q9NPD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms