Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB9BQ9NP90 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB9BQ9NP90 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms