Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
C10orf88Q9H8K7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C10orf88Q9H8K7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C10orf88Q9H8K7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms