Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNDC4Q9H6D8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms