Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RABEP2Q9H5N1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABEP2Q9H5N1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABEP2Q9H5N1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms