Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIBC2Q9H4K1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms