Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC3Q9H361 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC3Q9H361 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC3Q9H361 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms