Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MIXL1Q9H2W2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MIXL1Q9H2W2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MIXL1Q9H2W2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms