Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASSF4Q9H2L5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RASSF4Q9H2L5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RASSF4Q9H2L5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms