Protein–RNA interactions for Protein: Q9H074

PAIP1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1Q9H074 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAIP1Q9H074 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAIP1Q9H074 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAIP1Q9H074 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAIP1Q9H074 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAIP1Q9H074 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAIP1Q9H074 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAIP1Q9H074 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAIP1Q9H074 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms