Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NACA2Q9H009 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NACA2Q9H009 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NACA2Q9H009 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms