Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKRN2Q9H000 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKRN2Q9H000 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKRN2Q9H000 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN2Q9H000 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKRN2Q9H000 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms