Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTR3CQ9C0K3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTR3CQ9C0K3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms