Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PUS3Q9BZE2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PUS3Q9BZE2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PUS3Q9BZE2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms