Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL3Q9BY60 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL3Q9BY60 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms