Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RSPO3Q9BXY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RSPO3Q9BXY4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RSPO3Q9BXY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms