Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF7Q9BWX1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF7Q9BWX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms