Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HIRIP3Q9BW71 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HIRIP3Q9BW71 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HIRIP3Q9BW71 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HIRIP3Q9BW71 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms