Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIOK2Q9BVS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIOK2Q9BVS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RIOK2Q9BVS4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms