Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC1Q9BTT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms