Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPPED1Q9BRF8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms