Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms