Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLSTN3Q9BQT9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLSTN3Q9BQT9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms