Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3GL2Q99962 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3GL2Q99962 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms