Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPAT1Q99943 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGPAT1Q99943 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPAT1Q99943 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.2 ms