Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRX2Q99811 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRX2Q99811 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRX2Q99811 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms