Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC38A3Q99624 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC38A3Q99624 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A3Q99624 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms