Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM209Q96SK2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM209Q96SK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms