Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMC6Q96SB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMC6Q96SB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMC6Q96SB8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms