Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PANX1Q96RD7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PANX1Q96RD7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PANX1Q96RD7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PANX1Q96RD7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PANX1Q96RD7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PANX1Q96RD7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms