Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF641Q96N77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF641Q96N77 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF641Q96N77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF641Q96N77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms