Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC74BQ96LY2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC74BQ96LY2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74BQ96LY2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms