Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX27Q96L92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX27Q96L92 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX27Q96L92 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms