Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SUSD3Q96L08 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD3Q96L08 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms