Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCORQ96JN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCORQ96JN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms