Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LOXL4Q96JB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LOXL4Q96JB6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOXL4Q96JB6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms