Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRMT2BQ96GJ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT2BQ96GJ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT2BQ96GJ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRMT2BQ96GJ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms