Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RNF185Q96GF1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF185Q96GF1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF185Q96GF1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms