Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP4Q96G21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IMP4Q96G21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms