Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM5Q96DZ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM5Q96DZ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1200.3 ms