Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TUBGCP3Q96CW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUBGCP3Q96CW5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBGCP3Q96CW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.3 ms