Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDCCAG3Q96C92 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCCAG3Q96C92 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms